Actuellement, il y a à l’IFEA un directeur, vingt cinq chercheurs et une équipe administrative et d’appui à la recherche de neuf personnes. Les chercheurs restent à l’IFEA pour des périodes allant de un à quatre ans. Le conseil scientifique du Pôle Amérique (IFEA et Centre Français d’Études Mexicaines et Centreaméricaines - CEMCA) se réunit annuellement, analyse les programmes, la politique scientifique de l’IFEA et désigne les nouveaux chercheurs.
Fer de lance de la communauté scientifique française dans les Andes, plus de 50 chercheurs et universitaires français sont associés à l’IFEA et sont accueillis régulièrement. La collaboration avec les scientifiques locaux s’établit dès la conception des programmes, se poursuit tout au long de leur réalisation en commun et débouche sur des publications scientifiques conjointes. Cette collaboration étroite se manifeste également par l’acceuil de boursiers des pays andins et par la co-édition d’ouvrages ((Travaux de l’IFEA, Actes & Mémoires, Bibliothèque andine de poche).
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