Ce programme regroupe les recherches qui étudient les faunes endémiques des Andes, depuis des temps reculés jusqu’à aujourd’hui.
D’un côté, les études paléontologiques menées par les chercheurs de l’IFEA cherchent à reconstituer l’histoire évolutive des écosystèmes andins à partir de l’étude anatomique des restes fossiles d’espèces mises au jour. Leurs analyses et interprétation permettent de comprendre les caractéristiques faunistiques, paléo-environnementales et paléo-climatiques des Andes à différentes époques lointaines.
D’un autre côté, l’IFEA soutient des recherches visant à conserver le patrimoine génétique d’espèces domestiques endémiques des Andes. Le cochon d’Inde est l’espèce modèle de ce programme à travers deux études complémentaires. La première est une étude phylogénétique, grâce à l’analyse de l’ADN mitochondriale de cochons d’Inde sauvages et domestiques, qui cherche à établir le processus de domestication de cette espèce et à identifier quels animaux domestiques actuels sont les plus proches des spécimens sauvages. La deuxième étude a pour but d’établir un protocole de cryoconservation d’embryons de cochons d’Inde afin de créer une banque génétique qui conserve les spécimens identifiés comme originels par la première étude.
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